Epoksit hidrolaz 3 - Epoxide hydrolase 3
| EPHX3 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tanımlayıcılar | |||||||||||||||||||||||||
| Takma adlar | EPHX3, ABHD9, EH3, epoksit hidrolaz 3 | ||||||||||||||||||||||||
| Harici kimlikler | OMIM: 617400 MGI: 1919182 HomoloGene: 69386 GeneCard'lar: EPHX3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortologlar | |||||||||||||||||||||||||
| Türler | İnsan | Fare | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Topluluk | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
| Konum (UCSC) | Tarih 19: 15.23 - 15.23 Mb | Tarih 17: 32.18 - 32.19 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed arama | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Vikiveri | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Epoksit hidrolaz 3 (ABHD9, EH3, EPHX3) tarafından kodlanmıştır EPHX3 gen, üçüncü tanımlanan izozim bir dizi epoksit hidrolaz izozimler yani epoksit hidrolazlar. Bu set şunları içerir: Mikrozomal epoksit hidrolaz (epoksit hidrolaz 1, EPHX1, mEH ve EH1 olarak da adlandırılır); epoksit hidrolaz 2 (aynı zamanda çözünür epoksit hidrolaz, EPHX2, sEH ve EH2 olarak da adlandırılır); ve enzimatik olarak çok daha az iyi tanımlanmış epoksit hidrolaz 4 (ayrıca ABHD7 ve EH4 olarak adlandırılır). Dört enzimin tümü bir Alfa / beta hidrolaz katlanması sahip olduklarını öne sürerek Hidroliz aktivite. EH1, EH2 ve EH3'ün su ekledikleri için böyle bir aktiviteye sahip oldukları gösterilmiştir. epoksitler nın-nin Doymamış yağ asitleri oluşturmak üzere yakın cis (bkz. cis-trans izomerizmi ) Ürün:% s; EH4 aktivitesi rapor edilmemiştir. İlk üç EH, hücre içi lokasyon, doku ekspresyon modelleri, substrat tercihleri ve dolayısıyla fonksiyonlar açısından farklılık gösterir. Bu işlevler, belirli yağ asidi epoksitlerinin biyolojik etkilerini sınırlandırmayı, diğer yağlı asit epoksitlerinin toksisitesini artırmayı ve ilaçların ve diğerlerinin metabolizmasına katkıda bulunmayı içerir. ksenobiyotikler.
Tarih
EH3, ilk olarak belirli bir özelliğe sahip olması nedeniyle ABHD9 olarak adlandırıldı. Protein alanı, Alfa / beta hidrolaz katlanması veya a / hidrolaz katlama alanı. Bu alan, diğer 30'dan fazla insanda bulunur hidrolitik enzimler dört epoksit hidrolaz dahil. EH3 geni (EPHX3) insan diziliminde 19p13.13 kromozom lokusunda keşfedildi.genetik şifre [5] Amino asit dizisine dayalı olarak, bir a / β hidrolaz katlama alanına sahip bir proteini kodlaması öngörülmüştür; kodlanan protein bu nedenle ABHD9 olarak adlandırıldı.[6] Yaklaşık 10 yıl sonra, ABHD9'un belirli yağlı asit epoksitlerini hidrolize etme kabiliyetine sahip olduğu tanımlandı.[7][8]
İfade
MEH'ye benzer, ancak sEH'den farklı olarak, EH3 membrana bağlı enzimdir. İfadesine göre mRNA fare dokusunda EH3, mEH veya sEH'den çok farklı bir dağılıma sahiptir: EH3 ekspresyonu cilt, akciğer, dil, yemek borusu ve midede yüksektir; pankreas ve gözde orta; iç organ yağları, lenf düğümleri, dalak, arkus aort ve kalp; karaciğer, böbrek, testis, yumurtalık bağırsağı ve beyinde düşük; ve iskelet kasında çok düşük.[7][8] İnsan dokularında ifadesi henüz rapor edilmemiştir.
Etkinlik ve işlev
ABHD9 ilk olarak EPHX3 geninin üzerinde hipermetile olduğunu doğrulayan çalışmalar oldu. CpG siteleri onun içinde Destekleyici (genetik) insan prostat kanseri dokularında, özellikle daha gelişmiş dokularda veya morfolojik kriterlere göre (örn. Gleason puanı ), daha agresif hastalıklar. Bu, gen susturma Promoter hipermetilasyonuna bağlı EPHX3'ün, prostat kanserinin başlamasına ve / veya ilerlemesine katkıda bulunabilir.[9] EPHX3'ün promotöründeki benzer CpG bölgesi hipermetilasyonları için doğrulanmıştır. kolorektal adenokarsinomlar.[10] Benzer promoter metilasyon modeli, henüz doğrulanmamış olmasına rağmen, insan malignantında da bulundu. melanom Dokular[11] ve insan mide kanseri hücre hatları.[12] Bu çalışmalar, EPHX'in susturulmasının (yani ABHD9 proteini olarak ifade edilememesinin) insanlarda belirli kanserlerin gelişmesine ve / veya ilerlemesine dahil olduğunu kesinlikle kanıtlamaz.
Daha yakın zamanlarda, ABHD9, metabolize etmek için epoksi hidrolaz aktivitesine sahip olarak karakterize edildi. epoxyeicosatrienoic asitler (EET'ler) ve epoksitleri linoleik asit (yani vernolik asitler [lökotoksinler olarak da adlandırılır] karşılık gelen diollerine.[7] Örneğin, belirli bir EET'yi (14,15-epoksi-5Z, 8Z, 11Z-eikosatrienoik asit) aşağıdaki gibi metabolize eder:
14,15-epoksi-5Z,8Z,11Z-eikosatrienoik asit + H2O → 14,15-dihidroksi-5Z,8Z,11Z-eikosatrienoik asit
Bu özel reaksiyonda, enzim EET'yi inaktive eder ve böylece bunun biyolojik aktivitesini ve örneğin kan basıncını düzenlemede etki ettiği diğer EET'leri sınırlama işlevi görebilir (bkz. epoxyeicosatrienoic asitler. Hidrolizinde biri izomer vernolik asit (12S, 13R-epoksi-cis-9-oktadekenoik asit)
12S,13R-epoksi-cis-9-oktadekenoik asit + H2O → 12S,13R-dihidroksi-9Zoktadekenoik asitler
ancak bir diol için enzim toksisitesini arttırır, örneğin akut solunum sıkıntısı sendromları (görmek vernolik asit ).[7][8] Enzim böylelikle, telefon sinyali EET'lerin aktivitesi, yine de linoleik asit epoksitlerin toksik etkilerine katkıda bulunur.
MEH ve daha az ölçüde sEH, ilaçları, yabancı toksik kimyasalları ve basit yağ asitleri olmayan bazı endojen bileşikleri metabolize ederken (bkz. Mikrozomal epoksit hidrolaz ve epoksit hidrolaz 2 ), EH3'ün bu tür substratlar üzerindeki aktivitesi, büyük olasılıkla henüz rapor edilmemiştir.
Referanslar
- ^ a b c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000105131 - Topluluk, Mayıs 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000037577 - Topluluk, Mayıs 2017
- ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
- ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
- ^ "EPHX3 Sembol Raporu | HUGO Gen İsimlendirme Komitesi". genenames.org. Alındı 2016-04-30.
- ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, ve diğerleri. (Aralık 2002). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- ^ a b c d Decker M, Adamska M, Cronin A, Di Giallonardo F, Burgener J, Marowsky A, Falck JR, Morisseau C, Hammock BD, Gruzdev A, Zeldin DC, Arand M (Ekim 2012). "EH3 (ABHD9): Yağ asidi epoksitleri için yüksek aktiviteye sahip yeni bir epoksit hidrolaz ailesinin ilk üyesi". Lipid Araştırma Dergisi. 53 (10): 2038–45. doi:10.1194 / jlr.M024448. PMC 3435537. PMID 22798687.
- ^ a b c Morisseau C (Ocak 2013). "Epoksit hidrolazların lipid metabolizmasındaki rolü". Biochimie. 95 (1): 91–5. doi:10.1016 / j.biochi.2012.06.011. PMC 3495083. PMID 22722082.
- ^ Stott-Miller M, Zhao S, Wright JL, Kolb S, Bibikova M, Klotzle B, Ostrander EA, Fan JB, Feng Z, Stanford JL (Temmuz 2014). "Prostat kanseri nüksü ile ilişkili hipermetile promoter bölgelerine sahip genlerin doğrulama çalışması". Kanser Epidemiyolojisi, Biyobelirteçler ve Önleme. 23 (7): 1331–9. doi:10.1158 / 1055-9965.EPI-13-1000. PMC 4082437. PMID 24718283.
- ^ Oster B, Thorsen K, Lamy P, Wojdacz TK, Hansen LL, Birkenkamp-Demtröder K, Sørensen KD, Laurberg S, Orntoft TF, Andersen CL (Aralık 2011). "Kolorektal adenomlarda ve karsinomlarda oldukça sık CpG ada hipermetilasyonunun tanımlanması ve doğrulanması". Uluslararası Kanser Dergisi. 129 (12): 2855–66. doi:10.1002 / ijc.25951. PMID 21400501. S2CID 35078536.
- ^ Furuta J, Nobeyama Y, Umebayashi Y, Otsuka F, Kikuchi K, Ushijima T (Haziran 2006). "Peroksiredoksin 2'nin susturulması ve insan malign melanomlarında varsayılan promoter bölgelerdeki 33 CpG adasının anormal metilasyonu". Kanser araştırması. 66 (12): 6080–6. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-0157. PMID 16778180.
- ^ Yamashita S, Tsujino Y, Moriguchi K, Tatematsu M, Ushijima T (Ocak 2006). "5-aza-2'-deoksisitidin tedavisi ve oligonükleotid mikrodizi kullanılarak mide kanseri hücre hatlarında metilasyon susturulmuş genler için kimyasal genomik tarama". Kanser Bilimi. 97 (1): 64–71. doi:10.1111 / j.1349-7006.2006.00136.x. PMID 16367923. S2CID 33738798.