Nudix hidrolaz - Nudix hydrolase - Wikipedia

NUDIX
PDB 1mp2 EBI.jpg
Bir Nudix hidrolazı olan MT-ADPRase'in yapısı Tüberküloz
Tanımlayıcılar
SembolNUDIX
PfamPF00293
Pfam klanCL0261
InterProIPR000086
NUDIX benzeri
PDB 1vk6 EBI.jpg
NADH pirofosfatazın (1790429) kristal yapısı Escherichia coli 2.20 a çözünürlükte k12
Tanımlayıcılar
SembolNUDIX benzeri
PfamPF09296
Pfam klanCL0261
InterProIPR015375
SCOP21vk6 / Dürbün / SUPFAM

Nudix hidrolazları bir üst aile hidrolitik enzimler yarma kabiliyeti nukleosit dibağlı fosfatlar x (herhangi bir kısım), dolayısıyla adı.[1][2][3] Reaksiyon, nükleosit monofosfat (NMP) artı X-P verir. Nudix enzimleriyle hidrolize edilen substratlar, çeşitli derecelerde substrat özgüllüğü ile nükleosit di- ve trifosfatlar, dinükleosit ve difosfoinositol polifosfatlar, nükleotid şekerleri ve RNA kapakları dahil olmak üzere çok çeşitli organik pirofosfatlar içerir.[3] Nudix üst ailesinin enzimleri, ökaryotlar, bakteriler ve arkeler dahil olmak üzere her tür organizmada bulunur.[3]

Nudix ailesinin iki bileşeni vardır: her iki tarafında alfa sarmalları olan bir beta tabakasının sözde Nudix katı ve katalitik ve metal bağlayıcı içeren Nudix motifi amino asitler. Nudix motifi GXXXXXEXXXXXXXXXREUXEEXGU'dur, burada U izolösin, lösin veya valindir ve X herhangi bir amino asittir. Bu, (genellikle) katalitik amino asitleri içeren kısa bir sarmal oluşturur. Nudix hidrolazları, aşağıdakilerin Dcp2'sini içerir. baştan çıkarma kompleksi, ADP-riboz difosfataz, MutT, ADPRase, Ap4A hidrolazlar, RppH ve diğerleri.[4]

Referanslar

  1. ^ Bessman MJ, Frick DN, O'Handley SF (Ekim 1996). "MutT proteinleri veya" Nudix "hidrolazları, çok yönlü, geniş çapta dağılmış" ev temizliği "enzimleri ailesi. J. Biol. Kimya. 271 (41): 25059–62. doi:10.1074 / jbc.271.41.25059. PMID  8810257.
  2. ^ Mildvan AS, Xia Z, Azurmendi HF, vd. (Ocak 2005). "Nudix hidrolazlarının yapıları ve mekanizmaları". Arch. Biochem. Biophys. 433 (1): 129–43. doi:10.1016 / j.abb.2004.08.017. PMID  15581572.
  3. ^ a b c McLennan AG (Ocak 2006). "Nudix hidrolaz üst ailesi". Hücre. Mol. Hayat Bilimi. 63 (2): 123–43. doi:10.1007 / s00018-005-5386-7. PMID  16378245.
  4. ^ Mildvan, A.S .; Xia, Z .; Azurmendi, H.F .; Saraswat, V .; Legler, P.M .; Massiah, M.A .; Gabelli, S.B .; Bianchet, M.A .; et al. (2005). "Nudix hidrolazlarının yapıları ve mekanizmaları". Biyokimya ve Biyofizik Arşivleri. 433 (1): 129–143. doi:10.1016 / j.abb.2004.08.017. PMID  15581572.