Küçük Cajal gövdesine özgü RNA 18 - Small Cajal body specific RNA 18

küçük Cajal vücuda özgü RNA 18
RF00283.jpg
Tahmin edilen ikincil yapı ve dizi koruma SCARNA18
Tanımlayıcılar
SembolSCARNA18
Alt. SembollerU91
RfamRF00283
Diğer veri
RNA tipGen; snRNA; snoRNA; scaRNA
Alan (lar)Ökaryota
GİTGO terimi GO ile başlamalıdır: GO terimi GO ile başlamalıdır: GO terimi GO ile başlamalıdır:
YANİİşletim Sistemi: 0000275
PDB yapılarPDBe

küçük Cajal vücuda özgü RNA 18 (Ayrıca şöyle bilinir U91 veya U4-8) bir tür küçük nükleer RNA hangi yerelleştirilir cajal cisimler ve değiştirilmesine rehberlik etmesi önerildi RNA polimeraz II yazılı ek yeri RNA'lar U1, U2, U4, U5 ve U12.[1]

Bu snoRNA U91, C / D kutusu snoRNA'lar sınıfı.[2] Darzacq tarafından tespit edildi[1] ve U4 snRNA C8'in 2'O-riboz metilasyonuna rehberlik ettiği tahmin edilmektedir. Bu C / D alanı daha sonra başka bir C / D kutusu alanı ile birlikte bulundu. U12-22. Bu snRNA'nın hem ikili (U12-22 / U4-8) hem de tekli (U4-8) formları Hela hücrelerinden saflaştırılmıştır.[1] İkili form U12-22 / U4-8'in nükleoplazmaya lokalize olduğu gösterilmiştir ve Cajal cisimciklerinde bulunduğu öne sürülürken, U4-8 tek alanının nükleolde biriktiği görülmektedir.[3] İnsanlarda, U12-88 / U4-8'in genomik konumu intergeniktir ve saflaştırılmış transkriptin metillenmiş bir guanozin başlığına sahip olduğu gösterildi, bu da bağımsız olarak RNA pol II tarafından transkribe edildiğini düşündürdü.[3]

Referanslar

  1. ^ a b c Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (2002). "Cajal vücuda özgü küçük nükleer RNA'lar: yeni bir 2'-O-metilasyon sınıfı ve psödoüridilasyon kılavuz RNA'lar". EMBO J. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC  126017. PMID  12032087.
  2. ^ Galardi, S .; Fatica, A .; Bachi, A .; Scaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (Ekim 2002). "Saflaştırılmış Kutu C / D snoRNP'ler, Hedef RNA'nın İn Vitro Bölgeye Özgü 2'-O-Metilasyonunu Yeniden Üretebilir". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  3. ^ a b Lestrade, Laurent; Weber, Michel J. (2006). "snoRNA-LBME-db, insan H / ACA ve C / D kutusu snoRNA'larının kapsamlı bir veritabanı". Nükleik Asit Araştırması. 34 (Ek 1: Veritabanı Sorunu): D158 – D162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.

Dış bağlantılar